La Secretaría de Evaluación y Control juega un papel fundamental en el Plan de Desarrollo de Medellín, asumiendo la responsabilidad de optimizar la capacidad institucional del Distrito Especial de Ciencia, Tecnología e Innovación. A través de un control interno eficiente, la Secretaría se encarga de proteger los recursos públicos y garantizar el cumplimiento de la misión del Distrito. Además, implementa soluciones tecnológicas inteligentes para mejorar la auditoría interna y el seguimiento de las acciones correctivas, con el fin de fortalecer la transparencia, la confianza ciudadana y alcanzar los objetivos estratégicos de la ciudad​.